Responsables de la plate-forme :

Responsable technique et coordinatrice | Laurence MOLINA
Responsable scientifique | Franck MOLINA


Demande de prestation :

Les demandes de prestations sont à faire en adressant un message  à l’adresse ppc[@]sys2diag.cnrs.fr.

En cliquant ici > Accédez au formulaire en ligne


Missions :

Les demandes de prestations sont à faire sur le site du Pôle Protéomique de Montpellier (PPM). Il vous faudra sélectionner dans le champs contact préalable : Plate-forme de protéomique clinique (SYS2DIAG) pour que votre requête nous soit acheminée.

La Plate-forme de Protéomique Clinique (PPC) vise à exploiter les derniers développements technologiques et bioinformatiques en protéomique pour la découverte et la validation de biomarqueurs dans des pathologies humaines complexes.
Les missions fixées pour la plate-forme protéomique clinique s’articulent autour de 2 axes :
– Développer de nouvelles approches méthodologiques pour la protéomique clinique dans le domaine de la préparation des échantillons biologiques (préfractionnement, enrichissement en protéines faiblement abondantes, …), de la séparation des protéines et de l’analyse bioinformatique des données.
– Rendre disponible aux équipes académiques et industrielles régionales et au-delà, une expertise médicale, biologique et technique en Protéomique Clinique.


Compétences :

Biochimie
● Aide à la conception des expériences protéomiques
● Préparation des échantillons biologiques pour l’analyse protéomique (préfractionnement, enrichissement protéique, …)
● Séparation des protéines par électrophorèse (1D et 2D)
● Analyse d’image (Progenesis Samespot, Sili2Dgel)
● Protéomiques quantitative et qualitative
● Dosages multiplexés

Biostatistique/Bioinformatique
● Management des données : Contrôle qualité des données, identification des biais, traitement préliminaire des données (normalisation, soustraction du bruit de fond)
● Analyses fonctionnelle des réseaux biologiques de protéines

Peptides arrays – analyse d’interactions
● Synthèse rapide d’un grand nombre de peptides différents sur membrane de cellulose (peptide arrays) pour la cartographie et la caractérisation d’épitopes et de sites d’interactions. La réactivité est facilement évaluée par des tests de type immuno-révélation.

Microfluidique
● Plateau d’analyses microfluidiques en phases homogènes et hétérogènes (droplets, vesicules, cellules)


Équipements :

● Séparation des protéines en gel mono et bi-dimensionnel et analyse d’image (Accès MS)
● Analyse multiplexées de type luminex® (Bioplex®, Biorad)
● Logiciels en biostatistiques, analyses de réseaux et en mathématiques: R, Cytoscape
● Serveurs de calcul et de stockage.
● Robot de synthèse Multipep (Intavis)
● Système d’analyse microfluidique (Microscope fluorescence, lasers, micro-pompes, cameras haute vitesse, etc.)


Accés :

La plate-forme accueille les projets du laboratoire mais aussi les projets d’équipes de recherche académiques ou privées sous forme de collaborations (ou de prestations). La Plateforme offre une expertise et des moyens techniques en biochimie, en biostatistiques, en bioinformatique, en microfluidique et en chimie du peptide appliqués aux domaines de la protéomique clinique.


Qualité :

Afin de pleinement souscrire aux critères de qualité la plateforme s’est engagé dans une démarche qualité.